Itinéraire 16 jours Japon ?

Chers connaisseurs du Japon,

Je me permet de vous soumettre l'itinéraire que j'ai prévu pour mon 1er voyage au Japon du 2 au 18 novembre prochain. J'ai choisit de faire l'impasse sur le Mont Fuji, Hiroshima et le château de Himeji car j'ai fait d'autres choix. J'ai cependant des hésitations quant à l'ordre de mes visites les derniers jours.

Arrivée 3.11. Tokyo 5 nuits sur place jusqu'au 8.11.
9.11 Départ pour Kanazawa, 1 nuit sur place.
10.11 Départ pour Kyoto, 4 nuits sur place.
13.11. Départ ? pour Naoshima, 2 nuits sur place.
15.11 Départ ? pour Miyajima, 1 nuit sur place.
16.11 Départ pour Osaka, 1 nuit sur place.
17.11 Osaka - Tokyo, 1 nuit sur place.
18.11 Retour.

A votre avis, dans quel ordre dois-je place les visites de Naoshima et Miyajima afin que cela soit le plus pratique possible ? J'ai choisit de passer deux nuits à Naoshima car j'adore l'art contemporain.
Pensez-vous que je doive prendre le JR Pass pour 14 jours ? avec celui de 7 jours, cela sera insuffisant ? Même si j'en aurai besoin que 9 jours en fait.

Merci pour vos conseils éclairés, et bonne journée à tous.